!!!生物信息学与系统生物学

* 时间：2011年3月23日-2011年5月27日，每周三、五上午8:00-9:40
* 地点: 中科院研究生院中关村教学楼N306教室

!!教学目的和要求

生物信息学和系统生物学是当前国际上的研究热点和前沿领域。生物信息学是综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具，来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义。而系统生物学是在系统水平上对生物系统和生命现象的研究。它是一个在整体论哲学层面指导下在技术层面整合不同层次信息、不同层次（学科）技术、不同层次系统以理解生命系统如何行使功能的崭新领域。生物信息学和系统生物学是一个广泛的迅速发展的新领域，也是一个多学科参与的交叉学科。通过本课程研究生能够对生物信息学和系统生物学的发展动态及前沿方向有一个初步的认识，能够掌握生物信息学和系统生物学的基本概念和常用方法，能够独立查询与阅读相关文献和使用相关数据库与软件工具，同时对于生物信息学和系统生物学中的重要问题以及研究过程有一个系统而深入的了解，为进一步的科研工作打下坚实基础。

!!课件

* [绪论1|Course001/Introduction-1.pdf]
* [绪论2|Course001/Introduction-2.pdf]
* [生物信息学1. 基础知识|Course001/Bioinformatics-1.pdf]
* [生物信息学2. 序列分析与比对|Course001/Bioinformatics-2.pdf]
* [生物信息学3. 单体型组装与推断|Course001/Bioinformatics-3.pdf]
* [生物信息学4. 蛋白质结构预测|Course001/Bioinformatics-4.pdf]
* [生物信息学5. 蛋白质结构比较|Course001/Bioinformatics-5.pdf]
* [生物信息学6. 功能预测与注释|Course001/Bioinformatics-6.pdf]
* [生物信息学7. 基因组变异分析|Course001/Bioinformatics-7.pdf]
* [生物信息学8. 基因芯片与蛋白质谱数据分析|Course001/Bioinformatics-8.pdf]
* [计算系统生物学1. 概述|Course001/SystemsBiology-1.pdf]
* [计算系统生物学2. 基因调控网络推断|Course001/SystemsBiology-2.pdf]
* [计算系统生物学3. 转录调控网|Course001/SystemsBiology-3.pdf]
* [计算系统生物学4. 转录因子合作网络|Course001/SystemsBiology-4.pdf]
* [计算系统生物学5. 网络分析|Course001/SystemsBiology-5.pdf]
* [计算系统生物学6. 网络比对|Course001/SystemsBiology-6.pdf]
* [计算系统生物学7. 活性通路|Course001/SystemsBiology-7.pdf]

!!参考书
* __Bioinformatics__. Andrzej Polanski and Marek Kimmel, Springer, 1 edition, May 29, 2007.
* __Biomolecular Networks: Methods and Applications in Systems Biology__. Luonan Chen, Ruisheng Wang, Xiang-Sun Zhang, John Wiley & Sons, Hoboken, New Jersey, July, 2009.